1. Screening Libraries
  2. Virtual Screening

Virtual Screening

虚拟筛选 (Virtual Screening, VS) 是基于小分子数据库开展的活性化合物筛选。利用小分子化合物与药物靶标间的分子对接运算,虚拟筛选可快速从几十至上百万分子中,遴选出具有成药性的活性化合物,大大降低实验筛选化合物数量,缩短研究周期,降低药物研发的成本。据报道虚拟筛选的阳性率为5%-30%,利用虚拟筛选成功辅助药物设计的案例逐年增多,虚拟筛选已成为目前最有潜力的药物开发工具。

MCE 拥有丰富的数据库资源、高性能的计算机服务器,可提供专业的分子对接、虚拟筛选服务。经优化的虚拟筛选方案可大规模减少需实验筛选的化合物数量,提升理想先导物发现的可能性,缩短虚拟筛选服务时间,同时降低后期先导物优化失败的风险。针对具体需求,可量身定做高性价比的服务方案,为广大科研客户提供优质的早期药物研发服务。

Virtual Screening

虚拟筛选流程

虚拟筛选方法主要分为基于受体生物大分子结构的虚拟筛选 (structure-based virtual screening, SBVS) 和基于配体小分子的虚拟筛选 (ligand-based virtual screening, LBVS) 两种。

•   SBVS 基于受体的虚拟筛选

基于受体的虚拟筛选即基于分子对接的虚拟筛选,是根据实验测定的或同源模建的受体生物大分子的三维结构,通过分子对接的方法,确定小分子与受体的结合构象,根据与结合能相关的亲合性打分函数对蛋白和小分子化合物的结合能力进行评价,最终从大量的化合物分子中挑选出结合模式比较合理的、预测得分较高的化合物,用于后续的生物活性测试。

•   LBVS 基于配体的虚拟筛选

基于配体的虚拟筛选即基于药效团模型的虚拟筛选,是根据现有药物的结构、理化性质和活性关系的分析,建立定量构效关系或药效基团模型,预测筛选新化合物的活性。

服务内容

MCE 向广大具有虚拟药物筛选需求的客户提供整套虚拟药物筛选服务,客户只需提供靶标相关的生物学信息,我们将为您筛选最优的活性化合物,为进一步的生物活性评价奠定基础。服务内容包括:

•   靶点调研

•   模型构建

•   小分子化合物库制备

•   分子对接筛选/药效团建模及筛选

•   人工挑选

•   理想实体化合物的组库

服务优势

•   高性能的计算机服务器

•   丰富的数据库资源,包含200万+可购买化合物

•   专业的分子模拟和药物设计团队

•   高度标准的数据隐私管理

•   具有竞争力的价格优势

MCE SBVS Protocol

数据库资源

Cat. No. 虚拟筛选库类别 分子数量 特点
HY-L001V MCE Bioactive Compound Library 7,439 MCE活性化合物数据库,含有 7,439 种已知高活性的化合物集合,结构多样,是老药新用、新适应症筛选的有效工具。国内现货供应。
HY-L032V MCE Fragment Library 8,383 基于 RO3 原则精选 8,383 种片段化合物,用于 FBDD。国内现货供应。
HY-L0051V HTS Compound Library 1,938,649 包含 1,938,649 种具有独特结构和性质的化合物,数量大,结构多样性丰富。
HY-L0052V Advanced Library 531,580 包含 531,580 种类先导化合物,化合物的多官能团和类先导化合物的特性使 Advanced 库成为先导化合物发现的有效工具。
HY-L0053V Premium Library 138,801 138,801 种最具最佳分子特性 (高 Fsp3、低 logP 和 MW ) 的化合物集合,精选库。
HY-L0072V Agro-like Library 15,085 来源于 Enamine, 用于农业/作物科学的化合物库。
HY-L0059V Allosteric GPCR Library 17,385 来源于 Enamine, GPCR 数据库子库,用于发现新的 GPCR 变构配体。
HY-L0063V Allosteric Kinase Library 5,678 来源于 Enamine, 通过分子对接等精心挑选的变构激酶抑制剂。
HY-L0073V Antiviral Library 3,700 来源于 Enamine, 包含 3,700 种具有抗病毒活性的化合物。
HY-L0074V Aquaporins Library 1,500 来源于 Enamine, 包含靶向水通道蛋白的 1,500 种的化合物。
HY-L0075V BACE Library 7,171 来源于 Enamine, 靶向 β-分泌酶 (BACE) 的小分子化合物库。
HY-L0065V CNS Library 47,040 来源于 Enamine, 具有高 CNS MPO 得分的小分子化合物数据库。
HY-L0076V Covalent Screening Library 21,969 来源于 Enamine, 带有 "弹头" 结构可用于共价靶向修饰的化合物集合。
HY-L0054V Discovery Diversity Set 10 10,240 Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) 专注于新型化合物结构式,适合新型化合物的随机筛选。DDS 库含有共60,480个新型化合物。Discovery Diversity Set 10 由高度特异且不重复的 10,240 个化合物组成。
HY-L0055V Discovery Diversity Set 50 50,240 Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) 专注于新型化合物结构式,适合新型化合物的随机筛选。Discovery Diversity Set 50 是 Discovery Diversity Set 10 的补充,由 50,240 个化合物组成。
HY-L0077V DNA Library 5,530 来源于 Enamine, 靶向 DNA 稳定性必需蛋白质的化合物库。
HY-L0078V Epigenetics Library 9,353 来源于 Enamine, 靶向表观遗传靶标如 DNA 甲基转移酶、组蛋白甲基转移酶的化合物库。
HY-L0079V Glycomimetic Library 2,718 来源于 Enamine, 能够模拟糖苷及其与蛋白质的相互作用的化合物集合。
HY-L0058V GPCR Library 54,077 来源于 Enamine, 靶向 GPCR 的数据库。
HY-L0056V Hit Locator Library 200 200,000 Enamine Hit Locator Library (HLL) 是一个相当大的高度多样化的化合物库,由 500,160 个类先导物化合物组成,Hit Locator Library 200 由 Hit Locator Library 中精选的 200,000 个核心化合物组成。
HY-L0057V Hit Locator Library 500 500,160 Enamine Hit Locator Library (HLL) 是一个相当大的高度多样化的化合物库,由 500,160 个类先导物化合物组成,Hit Locator Library 500 为 Hit Locator Library 总库,由 500,160 个化合物组成。
HY-L0070V IDO Targeted Library 5,502 来源于 Enamine, 靶向吲哚胺2,3-双加氧酶 (IDO) 的化合物库。
HY-L0067V Immuno-Oncology Library 52,935 来源于 Enamine, 专为在免疫肿瘤治疗领域发现新型化合物而设计。
HY-L0064V Ion Channel Library 30,418 来源于 Enamine, 用于发现新的离子通道配体。
HY-L0071V JAK/STAT Compound Library 1,390 来源于 Enamine, 靶向 JAK-STAT 信号途径的化合物库。
HY-L0062V Kinase Hinge Region Directed Library 18,020 来源于 Enamine, 靶向 ATP 结合口袋的激酶抑制剂。
HY-L0061V Kinase Library 67,385 来源于 Enamine, 用于发现新的蛋白激酶抑制剂。
HY-L0068V Kynurenine Pathway Library 12,300 来源于 Enamine, 包含 12,300 个靶向犬尿氨酸代谢途径关键酶的新型化合物。
HY-L0060V Lipid GPCR Library 7,512 来源于 Enamine, GPCR 数据库子库,用于发现新的脂质 GPCR 配体。
HY-L0080V Lipoxygenase Library 1,388 来源于 Enamine, 通过分子对接和 2D 相似性搜索的脂氧合酶 (LOXs) 抑制剂化合物库。
HY-L0081V Molecular Chaperones Library 2,451 来源于 Enamine, 包含靶向分子伴侣的 2,451 个化合物。
HY-L0082V Nucleoside Mimetics Library 277 来源于 Enamine, 包含 277 个核酸类似物。
HY-L0083V Protein Mimetics Library 11,570 来源于 Enamine, 包含靶向 α-螺旋和 β-转角结构域的 11,570 种化合物。
HY-L0066V Protein-Protein Interaction Library 59,370 来源于 Enamine, 用于发现新的 PPI 抑制剂。
HY-L0084V RNA Library 9,070 来源于 Enamine, 可能结合 RNA 的化合物库。
HY-L0069V Serine Hydrolase Library 12,040 来源于 Enamine, 可能与丝氨酸残基形成共价键的精选化合物库。
HY-L0086V Specs HTS Compounds Library 210,454 来源于 Specs, 包含 210,454 种化合物,多样性丰富,适用于高通量筛选。
HY-L0085V Tubulin Library 3,454 来源于 Enamine, 靶向微管蛋白的化合物库。

MCE 虚拟筛选服务可以显著提高先导化合物命中率并降低后期的实验筛查成本。虚拟筛选技术服务是一种个性化定制的创新型的科研服务,每个项目需经评估后才能确定对应的分析方案和价格。进一步了解服务价格或技术详情等信息,请发邮件至 sales@MedChemExpress.cn 或直接联系 MCE 的销售人员。