1. Gene
  2. SYT5 - synaptotagmin 5 Gene

SYT5 - synaptotagmin 5 Gene

中文名称:突触结合蛋白 5

种属: Homo sapiens

基因 ID: 6861 | 基因类型: protein coding

关于 SYT5

Cytogenetic location: 19q13.42 Genomic coordinates (GRCh38): 19:55,171,196-55,180,289 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 102 orthologues and 31 paralogues. Biased expression in brain (RPKM 20.3) and adrenal (RPKM 2.1).

功能概要

突触结合蛋白,例如 SYT5,是一个 III 型膜蛋白家族,其特征在于与蛋白激酶 C (参见 MIM 176960) 调节 (C2) 结构域相关的细胞质重复序列,其被认为可结合钙。突触结合蛋白既可以作为囊泡融合的负调节因子,允许在钙存在下融合,也可以作为钙受体或传感器分子 (Hudson 和 Birnbaum 总结,1995 [PubMed 7597049]) 。[OMIM 提供,2011 年 2 月]

Synaptotagmins, such as SYT5, are a family of type III membrane proteins characterized by cytoplasmic repeats related to protein kinase C (see MIM 176960) regulatory (C2) domains, which are thought to bind calcium. Synaptotagmins may act both as negative regulators of vesicle fusion, allowing fusion in the presence of calcium, and as calcium receptors or sensor molecules (summary by Hudson and Birnbaum, 1995 [PubMed 7597049]).[supplied by OMIM, Feb 2011]

SYT5 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001297774.2 NP_001284703.1 synaptotagmin-5 isoform 2
NM_003180.3 NP_003171.2 synaptotagmin-5 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables calcium ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27793683 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SYT5 蛋白结构

C2

C2: C2 domain (125 - 211)

C2

C2: C2 domain (256 - 343)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 386 a.a.
蛋白主名 其他名称

synaptotagmin-5

synaptotagmin V

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus SYT5 VGNC VGNC:35544
Mus musculus SYT5 MGD MGI:1926368
Macaca mulatta SYT5 VGNC VGNC:78077
Rattus norvegicus SYT5 RGD RGD:3806
Felis catus SYT5 VGNC VGNC:65900
Canis familiaris SYT5 VGNC VGNC:47048