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SPOCK2 - SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 2 Gene

中文名称:SPARC (骨连蛋白) 、cwcv 和 kazal 样结构域蛋白聚糖 2

种属: Homo sapiens

同用名: testican-2

基因 ID: 9806 | 基因类型: protein coding

关于 SPOCK2

Cytogenetic location: 10q22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 10:72,059,034-72,089,032 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 210 orthologues and 3 paralogues. Biased expression in lung (RPKM 58.9), brain (RPKM 55.4) and 13 other tissues.

功能概要

该基因编码一种蛋白质,该蛋白质与糖胺聚糖结合形成细胞外基质的一部分。该蛋白质包含 1 型甲状腺球蛋白、卵泡抑素样和钙结合结构域,并在酸性 C 末端区域具有糖胺聚糖附着位点。已经针对该基因描述了编码不同蛋白质亚型的三种可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2011 年 10 月]

This gene encodes a protein which binds with glycosaminoglycans to form part of the extracellular matrix. The protein contains thyroglobulin type-1, follistatin-like, and calcium-binding domains, and has glycosaminoglycan attachment sites in the acidic C-terminal region. Three alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

SPOCK2 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001134434.1 NP_001127906.1 testican-2 isoform 1 precursor
NM_001244950.2 NP_001231879.1 testican-2 isoform 2 precursor
NM_014767.2 NP_055582.1 testican-2 isoform 2 precursor
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables calcium ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10386950 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SPOCK2 蛋白结构

Kazal_2

Kazal_2: Kazal-type serine protease inhibitor domain (139 - 180)

SPARC_Ca_bdg

SPARC_Ca_bdg: Secreted protein acidic and rich in cysteine Ca binding region (197 - 305)

Thyroglobulin_1

Thyroglobulin_1: Thyroglobulin type-1 repeat (313 - 376)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 424 a.a.
蛋白主名 其他名称

testican-2

SPARC/osteonectin, CWCV, and Kazal-like domains proteoglycan 2

SPOCK2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SPOCK2 Q92563 ENKD1 Homo sapiens Q9H0I2 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris SPOCK2 VGNC VGNC:46751
Macaca mulatta SPOCK2 VGNC VGNC:106105
Rattus norvegicus SPOCK2 RGD RGD:1308568
Mus musculus SPOCK2 MGD MGI:1891351
Bos taurus SPOCK2 VGNC VGNC:35226