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抗 COVID-19 化合物库更新啦!

 

 

 

MCE 抗 COVID-19 化合物库上线后,受到广大科研人员的热切关注。为进一步提高抗 COVID-19 化合物库的筛选范围,我司针对已经报道的病毒 S 蛋白 (Spike Glycoprotein) 及人血管紧张素转换酶 2 (ACE2, Angiotensin Converting Enzyme 2)结构,用 MCE 老药新用化合物库进一步进行虚拟筛选,增加了近 500 多种可能对 COVID-19 有治疗作用的小分子化合物。
 

 

在与新型冠状病毒(2019-nCoV)奋战的 3 个多月里,我们对这种病毒的认识逐渐加深。不同的科研团队陆续发表了对冠状病毒基因水平,蛋白质结构及病理等方面的研究成果。新型冠状病毒是一种正链 RNA 病毒,其基因组与 SARS-CoV 有 80% 的相似性,与蝙蝠冠状病毒有 96% 的相似性。

致病机理

研究表明,新型冠状病毒致病机理与 SARS-CoV 类似,都是通过病毒表面的 S 蛋白介导受体识别和细胞膜的融合。在病毒成熟过程中,三聚体 S 蛋白被裂解成 S1 和 S2 亚基,S1 亚基包含受体结合域 (RBD), 可以直接与人细胞表面的膜蛋白 ACE2 结合,而 S2 亚基负责膜融合。

当 S1 亚基与 ACE2 结合后,S2 亚基中的另一个切割位点暴露,被宿主体内的蛋白酶切割,这个过程对于病毒的侵染至关重要。不过新型冠状病毒的 S 蛋白与 SARS 病毒的 S 蛋白在结构上存在差异,且更容易与 ACE2 蛋白结合,结合率是 SARS 病毒的 10-20 倍,这也解释了为什么新冠病毒的传染性如此之强。

图 1. 2019-nCoV S 蛋白结构图

 图 2.  ACE2-B0AT1 复合物的冷冻电镜密度图
化合物库

由其致病机理可以看出,S 蛋白及 ACE2 蛋白是治疗 COVID-19 的重要靶点。MCE 在原来 3CL 蛋白水解酶结构虚拟筛选的基础上,又进行了对 MCE 老药新用化合物库 (HY-L035) 基于 S 蛋白及 ACE2 蛋白结构的虚拟筛选,共收录了近 1000 种可能对新型冠状病毒有治疗效果的化合物,增加了抗 COVID-19 化合物库的筛选范围及能力。

除此之外,一些广谱的抗病毒药物在本次疫情控制中也发挥了重要作用,如磷酸氯喹 (HY-17589),瑞德西韦 (HY-104077)、克力芝等,因此针对抗病毒化合物库的筛选也极为重要。

MCE 抗 COVID-19 化合物库及抗病毒化合物库是筛选抗新型冠状病毒药物的有效工具,MCE 愿为加速药物的开发尽绵薄之力!

相关产品

HY-L052 抗 COVID-19 化合物库

MCE 发挥自身虚拟筛选优势,基于 3CL 水解酶(PDB ID: 6LU7), S 蛋白 (Spike Slycoprotein) 及 ACE2 (人蛋白血管紧张素转换酶 2) 结构对已有的上市药物库及临床化合物库,进行虚拟筛选,汇总整理出 1001 个可能具有抗新型冠状病毒活性的化合物集合,是筛选抗新型冠状病毒药物的有力工具。

HY-L027 抗病毒化合物库

MCE 抗病毒化合物库收录了 314 种已经明确报道具有抗病毒活性的小分子化合物,主要靶向 HBV, HCV, HIV, HSV,流感病毒等,包含多种广谱的抗病毒药物,可以用于抗病毒药物的高通量筛选。 

HY-L002 抗感染化合物库

MCE 提供 973 种抗细菌、抗病毒、抗真菌及抗寄生虫等抗感染化合物,可以用于抗感染药物的高通量筛选及抗感染领域的其他研究。

参考文献:

[1] Renhong Yan,Yuanyuan Zhang, Yaning Li, Lu Xia, Qiang Zhou. Structure of dimeric full-lengthhuman ACE2 in complex with B0AT1. bioRxiv 2020.02.17.951848.

[2] DanielWrapp, Nianshuang Wang, Kizzmekia S. Corbett, etc. Cryo-EM structure of the2019-nCoV spike in the prefusion conformation. Science  19 Feb 2020, eabb2507.

[3] Renhong Yan, Yuanyuan Zhang, Yingying Guo, Lu Xia, Qiang Zhou. Structural basisfor the recognition of the 2019-nCoV by human ACE2. bioRxiv 2020.02.19.956946.

[4] Belouzard S, Chu VC, Whittaker GR. Activation of the SARS coronavirus spike proteinvia sequential proteolytic cleavage at two distinct sites. Proc Natl Acad Sci USA.2009;106(14):5871-6.