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检索工具总动员,总有一款适合你

 

 

 

 
“工欲善其事,必先利其器”,全面系统地检索文献可以帮助小伙伴们明确课题相关的研究方向和研究方法。所以常备几个文献资源全的数据库就尤为重要!

今天我们就以小白的课题——自噬 (Autophagy) 为例,给大家展示一波。如果要研究自噬,首先就要先了解什么是自噬。这个时候给大家隆重介绍我们的“男一号”——PubMed。

 

 
“男一号”——PubMed
 

提到 PubMed,相信大家应该都不陌生,它是常用的国外数据库之一,也是小编查找文献的首选工具。


自成立以来,PubMed 一直是检索生物医学文献的主要工具,可提供对 MEDLINE 的访问。截至 2010 年,有超过 2000 万篇引文通过 PubMed 编入索引。对于小编来说,最重要的是,PubMed 它免费啊!!

 

尽管 PubMed 提供广泛、最新的文献信息,但由于生物医学方面的文献越来越多,研究者们快速识别与自身需求相关的信息也越来越具有挑战性。同时,PubMed 的检索方式多样,检索的逻辑也较为复杂,但是小编还是喜欢用简单粗暴的方式查阅文献。

 

图 1. 用户使用 PubMed 的一般流程[1]


首先,进入 PubMed 的界面,不得不夸一句,界面相当简洁清晰,这里我们只需输入关键词就可以找到相关的信息。注意!关键词一定要贴近主题,最好选取多个关键字,否则你只能得到大量有用信息的冰山一角。

 

图 2. PubMed 检索首页

 

比如上面提到的“自噬”,如果你不了解自噬,可以把 “Autophagy; review” 作为关键词在 PubMed 上进行搜索,此时会出现大量与自噬相关的文献。大概浏览论文之后,开始制定自己的实验计划。


研究自噬诱导剂还是抑制剂?
做细胞实验?动物实验?
做什么细胞或者什么动物模型?
……
此时,怎样高效,准确地搜索文章是关键!

 

细胞实验,这里,我们以自噬激活剂 Rapamycin,细胞系人纤维肉瘤细胞 (HT-1080) 为例。可直接以细胞系+产品名称作为关键词进行搜索,例如 “Rapamycin; HT-1080 cells”,这样搜出来的文献相关性会很高,参考价值也大不少呢。


如果要做小鼠实验,可直接搜索 “Rapamycin; mice”,如果搜出来的文献较多,还可以继续加关键词,譬如限定给药方式,造模类型等,“Rapamycin; mice;  i.p.” 或 “Rapamycin; mice; tumor”。关键词选的准确,会大大减少文献检索的时间。

 

图 3. “Autophagy; review”在 PubMed 上的检索结果

 

彩蛋时间:
使用 PubMed 时,给大家安利一个小插件 Scholarscope,有了它,就能更方便快捷的看到 PubMed 上不同文献的影响因子及分区,有利于大家更快速地找到高质量的文献。

 

 
“男二号”——Sci-Hub 文献检索
 

Sci-Hub 文献检索,可以说是文献检索上的科研利器。该网站数据资源全,不仅可以搜索到 PubMed 上查不到的文献,还包含众多学科和资料来源,大大节省了在不同网站之间切换搜索的时间和精力。然鹅,想要浏览或者下载全文可是有偿的~

 

图 4. Sci-Hub 文献检索首页

 

以上述例子 “Autophagy; review” 为关键词分别在 PubMed 和 Sci-Hub 文献检索工具上搜索,可以看到检索结果数目差的还是比较大的。

 

图 5. “Autophagy; review” 在 Sci-Hub 文献检索上的检索结果

 

以上两个工具基本上可以满足正常的检索需求了。当然,小编可不能藏私,再给大家介绍两个能下载全文的小工具~

 

1、Sci-Hub 之文献小镇

文献小镇,是一种通过文献标题,文献 DOI 号或者 PMID 号,直接搜索和下载文献全文的免费工具。不过并不是所有文献都能下载到全文,尤其是最新的文献,咱们就不指望它了。小编仰仗的是下一位神秘嘉宾。

 

图 6. 文献小镇检索首页

 

2、Bestdreams

Bestdreams 是一个专业医药化工数据信息平台,其将多种学术搜索网站汇总,中外文献基本都可以检索下载到,而且可以下载到最新的文献哦~小编在其他搜索引擎上下载不到的全文,最后的指望就是它!!!(也是有偿的哈)
 

图 7. Bestdreams 检索首页

 
学会了这么多文献检索的小技巧,小伙伴们是不是已经按捺不住那颗跃跃欲试的心了呢?当然,除了上述的一些工具,还有一大票比较热门的搜索引擎可供大家选择,大家觉得好用的文献检索工具也可以毫无保留的分享给萌 cece 哦!最后祝大家都能在大浪中淘到金、文海中捕获鱼,科研顺利!
 

相关产品

Rapamycin 

自噬激活剂;有效且特异性的 mTOR 抑制剂,与 FKBP12 结合且抑制 mTORC1;免疫抑制剂。

3-Methyladenine

PI3K 的抑制剂;通过抑制 class III PI3K 广泛作为自噬 (autophagy) 的抑制剂使用。

自噬化合物库

收录了 1000+ 种自噬信号通路相关的产品,是研究自噬相关调控及疾病的有用工具。

MCE 的所有产品仅用作科学研究或药证申报,我们不为任何个人用途提供产品和服务

 

 

 

参考文献

 

 

1. Zhiyong Lu, et al. PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature. Database (Oxford). 2011 Jan 18;2011:baq036.
2. F Timmins, et al. How to conduct an effective literature search. Nurs Stand. 2005 Nov 23-29;20(11):41-7.