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KDM1B - lysine demethylase 1B Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：赖氨酸脱甲基酶 1B

种属: Homo sapiens

同用名: AOF1; LSD2; C6orf193

基因 ID: 221656 | 基因类型: protein coding

关于 KDM1B

Cytogenetic location: 6p22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 6:18,155,422-18,223,854 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 207 orthologues and 7 paralogues. Broad expression in thyroid (RPKM 17.9), testis (RPKM 11.6) and 23 other tissues.

功能概要

黄素依赖性组蛋白去甲基化酶，如 KDM1B，调节组蛋白赖氨酸甲基化，这是一种调节基因表达和染色质功能的表观遗传标记 (Karytinos 等人，2009 [PubMed 19407342]) 。[OMIM 提供，2009 年 10 月]

Flavin-dependent histone demethylases, such as KDM1B, regulate histone lysine methylation, an epigenetic MARK that regulates gene expression and chromatin function (Karytinos et al., 2009 [PubMed 19407342]).[supplied by OMIM, Oct 2009]

KDM1B 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001364614.2 NP_001351543.1 lysine-specific histone demethylase 2 1
NM_153042.4 NP_694587.3 lysine-specific histone demethylase 2 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables FAD binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
enables FAD-dependent H3K4me/H3K4me3 demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
enables histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23260659 GOA
enables zinc ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in transcription initiation-coupled chromatin remodeling IDA
IDA: 通过直接分析推断
30970244 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in chromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
30970244 GOA
part of nucleosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
23260659 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

KDM1B 蛋白结构

zf-CW

zf-CW: CW-type Zinc Finger (137 - 192)

Thi4

Thi4: Thi4 family (247 - 300)

Amino_oxidase

Amino_oxidase: Flavin containing amine oxidoreductase (319 - 587)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 590 a.a.
蛋白主名 其他名称

lysine-specific histone demethylase 2

lysine-specific histone demethylase 1B

flavin-containing amine oxidase domain-containing protein 1

KDM1B 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P83638 KDM1B Antibody (YA3383) WB, ICC/IF, IP, FC Human, Mouse, Rat

相关产品

Pre-clinical Phase
生物活性分子 (3)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS07208 KDM1B Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS21615 Kdm1b Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS28133 Kdm1b Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus KDM1B VGNC VGNC:63068
Bos taurus KDM1B VGNC VGNC:30523
Macaca mulatta KDM1B VGNC VGNC:73878
Canis familiaris KDM1B VGNC VGNC:42319
Mus musculus KDM1B MGD MGI:2145261
Rattus norvegicus KDM1B RGD RGD:1310701
Others KDM1B NCBI
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