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APOBEC3D - apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D Gene

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中文名称：载脂蛋白 B mRNA 编辑酶催化亚基 3D

种属: Homo sapiens

同用名: A3D; A3DE; ARP6; APOBEC3E; APOBEC3DE

基因 ID: 140564 | 基因类型: protein coding

关于 APOBEC3D

Cytogenetic location: 22q13.1 Genomic coordinates (GRCh38): 22:39,021,127-39,033,277 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 48 orthologues and 9 paralogues. Broad expression in lymph node (RPKM 5.2), spleen (RPKM 4.6) and 22 other tissues.

功能概要

该基因是胞苷脱氨酶基因家族的成员。它是在一个簇中发现的一组相关基因之一，被认为是由 22 号染色体上的基因复制引起的。该簇的成员编码的蛋白质在结构和功能上与 C 到 U RNA 编辑胞苷脱氨酶 APOBEC1 相关，并抑制通过使新生逆转录病毒 cDNA 中的胞嘧啶残基脱氨基来去除逆转录病毒，例如 HIV。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene is a member of the cytidine deaminase gene family. It is one of a group of related genes found in a cluster, thought to result from gene duplication, on chromosome 22. Members of the cluster encode proteins that are structurally and functionally related to the C to U RNA-editing cytidine deaminase APOBEC1 and inhibit retroviruses, such as HIV, by deaminating cytosine residues in nascent retroviral cDNA. [provided by RefSeq, Jul 2008]

APOBEC3D 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001363781.1 NP_001350710.1 DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D isoform 2
NM_152426.4 NP_689639.2 DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D isoform 1
基因本体论
  • 生物过程
  • 细胞组分
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA cytosine deamination IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
involved in clearance of foreign intracellular DNA IDA
IDA: 通过直接分析推断
20062055 GOA
involved in defense response to virus IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
involved in negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in P-body IDA
IDA: 通过直接分析推断
22915799 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
21835787 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

APOBEC3D 蛋白结构

APOBEC_N

APOBEC_N: APOBEC-like N-terminal domain (68 - 197)

APOBEC_N

APOBEC_N: APOBEC-like N-terminal domain (216 - 384)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 386 a.a.
蛋白主名 其他名称

DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D

apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3D

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疾病名称 别名
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生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS00838 APOBEC3D Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus APOBEC3D MGD MGI:1933111
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