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NUDT16 - nudix hydrolase 16 Gene

中文名称:nudix 水解酶 16

种属: Homo sapiens

基因 ID: 131870 | 基因类型: protein coding

关于 NUDT16

Cytogenetic location: 3q22.1 Genomic coordinates (GRCh38): 3:131,381,671-131,388,830 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 183 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in fat (RPKM 14.5), kidney (RPKM 13.4) and 25 other tissues.

功能概要

启用多种功能,包括 RNA 结合活性;金属离子结合活性;和嘌呤核糖核苷三磷酸结合活性。参与 IDP 分解代谢过程; RNA 代谢过程;和细胞周期过程的正调控。位于细胞质中;核仁;和核质。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables several functions, including RNA binding activity; metal ion binding activity; and purine ribonucleoside triphosphate binding activity. Involved in IDP catabolic process; RNA metabolic process; and positive regulation of cell cycle process. Located in cytoplasm; nucleolus; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

NUDT16 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001171905.2 NP_001165376.1 U8 snoRNA-decapping enzyme isoform 3
NM_001171906.2 NP_001165377.1 U8 snoRNA-decapping enzyme isoform 1
NM_152395.3 NP_689608.2 U8 snoRNA-decapping enzyme isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables 5'-(N(7)-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15053875 GOA
enables IDP phosphatase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
20385596 GOA
enables chloride ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
29483298 GOA
enables cobalt ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
17567574 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
26121039 GOA
enables mRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21337011 GOA
enables magnesium ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
17567574 GOA
enables manganese ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
17567574 GOA
enables metalloexopeptidase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21337011 GOA
enables phosphodiesterase decapping endonuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
29483298 GOA
enables protein homodimerization activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
17567574 GOA
enables snoRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18820299 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in NAD-cap decapping IDA
IDA: 通过直接分析推断
32432673 GOA
involved in mRNA catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
21070968 GOA
involved in positive regulation of cell cycle process IMP
IMP: 通过突变表型推断
20385596 GOA
involved in sno(s)RNA catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
15053875 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
20385596 GOA
located in nucleolus IDA
IDA: 通过直接分析推断
20385596 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
20385596 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

NUDT16 蛋白结构

NUDIX

NUDIX: NUDIX domain (45 - 119)

  • 0
  • 100
  • 195 a.a.
蛋白主名 其他名称

U8 snoRNA-decapping enzyme

IDP phosphatase

NUDT16 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
NUDT16 Q96DE0 MTIF2 Homo sapiens P46199 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 NUDT16 Homo sapiens Q96DE0 26121039
种属内
NUDT16 Q96DE0 ACSF2 Homo sapiens Q96CM8 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 D2HGDH Homo sapiens Q8N465 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 NUDT16 Homo sapiens Q96DE0
GMS
26121039
种属内
NUDT16 Q96DE0 ATP12A Homo sapiens P54707 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 COL20A1 Homo sapiens Q9P218 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 UBR2 Homo sapiens Q8IWV8 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 BCKDK Homo sapiens O14874 33961781
种属内
NUDT16 Q96DE0 CRAT Homo sapiens P43155 33961781
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus NUDT16 RGD RGD:1311387
Canis familiaris NUDT16 VGNC VGNC:44028
Mus musculus NUDT16 MGD MGI:1922936
Bos taurus NUDT16 VGNC VGNC:32330
Felis catus NUDT16 VGNC VGNC:102790