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TRUB1 - TruB pseudouridine synthase family member 1 Gene

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中文名称：TruB 假尿苷合酶家族成员 1

种属: Homo sapiens

同用名: PUS4

基因 ID: 142940 | 基因类型: protein coding

关于 TRUB1

Cytogenetic location: 10q25.3 Genomic coordinates (GRCh38): 10:114,938,195-114,977,676 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants) and 194 orthologues. Ubiquitous expression in adrenal (RPKM 19.3), testis (RPKM 13.5) and 24 other tissues.

功能概要

伪尿苷是 rRNA 和 tRNA 的丰富成分，由伪尿苷合成酶通过尿苷异构化酶促生成 (Zucchini 等人，2003 [PubMed 12736709]) 。[OMIM 提供，2008 年 3 月]

Pseudouridine is an abundant component of rRNAs and tRNAs and is enzymatically generated by isomerization of uridine by pseudouridine synthase (Zucchini et al., 2003 [PubMed 12736709]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

TRUB1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_139169.5 NP_631908.1 pseudouridylate synthase TRUB1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables pre-miRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
32926445 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
33961781 GOA
enables pseudouridine synthase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
28073919 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA pseudouridine synthesis IDA
IDA: 通过直接分析推断
28073919 GOA
involved in positive regulation of pre-miRNA processing IDA
IDA: 通过直接分析推断
32926445 GOA
involved in tRNA modification IDA
IDA: 通过直接分析推断
32926445 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
28073919 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
28073919 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

TRUB1 蛋白结构

TruB_N

TruB_N: TruB family pseudouridylate synthase (N terminal domain) (106 - 255)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 349 a.a.
蛋白主名 其他名称

pseudouridylate synthase TRUB1

TruB pseudouridine (psi) synthase family member 1

TRUB1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TRUB1 Q8WWH5 CAPG Homo sapiens P40121
Anti Tag CoIP
33961781
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Dyskeratosis Congenita

Dyskeratosis Congenita Autosomal Dominant

Dc

Dkc

Zinsser-Engman-Cole Syndrome

Dyskeratosis Congenita, Autosomal Dominant

Autosomal Dominant Dyskeratosis Congenita

Dkca

Dyskeratosis Congenita Scoggins Type

Zinsser-Cole-Engman Syndrome

X-Linked Dyskeratosis Congenita

Hoyeraal-Hreidarsson Syndrome
Myopathy, Lactic Acidosis, And Sideroblastic Anemia 1

Mitochondrial Myopathy And Sideroblastic Anemia

MLASA1

Mlasa

Myopathy, Lactic Acidosis And Sideroblastic Anemia

Myopathy With Lactic Acidosis And Sideroblastic Anemia

Sideroblastic Anemia And Mitochondrial Myopathy

Myopathy With Lactic Acidosis And Sideroblastic Anemia 1
Dyskeratosis Congenita, X-Linked

DKCX

X-Linked Dyskeratosis Congenita

Zinsser-Cole-Engman Syndrome

Hoyeraal-Hreidarsson Syndrome

Dyskeratosis Congenita X-Linked

HHS

Cerebellar Hypoplasia With Pancytopenia

Prenatal Growth Retardation With Progressive Pancytopenia And Cerebellar Hypoplasia

Dyskeratosis Congenita
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS15128 TRUB1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TRUB1 VGNC VGNC:36404
Felis catus TRUB1 VGNC VGNC:66602
Mus musculus TRUB1 MGD MGI:1919383
Canis familiaris TRUB1 VGNC VGNC:47888
Macaca mulatta TRUB1 VGNC VGNC:79005
Rattus norvegicus TRUB1 RGD RGD:1308502
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