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PADI1 - peptidyl arginine deiminase 1 Gene

中文名称:肽基精氨酸脱亚胺酶 1

种属: Homo sapiens

同用名: PDI; PAD1; PDI1; HPAD10

基因 ID: 29943 | 基因类型: protein coding

关于 PADI1

Cytogenetic location: 1p36.13 Genomic coordinates (GRCh38): 1:17,205,128-17,246,007 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 235 orthologues and 4 paralogues. Biased expression in esophagus (RPKM 30.8) and skin (RPKM 4.2).

功能概要

该基因编码肽基精氨酸脱亚胺酶家族的成员,该酶通过在钙离子存在下将精氨酸残基转化为瓜氨酸来催化蛋白质的翻译后脱亚胺。该家族成员具有不同的底物特异性和组织特异性表达模式。 I 型酶参与表皮分化的后期阶段,在那里它去除聚丝蛋白和角蛋白 K1,从而维持角质层的水合作用,从而维持皮肤屏障功能。这种酶也可能在毛囊形成中发挥作用。该基因与其他四个旁系同源基因存在于一个簇中。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the peptidyl arginine deiminase family of Enzymes, which catalyze the post-translational deimination of proteins by converting arginine residues into citrullines in the presence of calcium ions. The family members have distinct substrate specificities and tissue-specific expression patterns. The type I enzyme is involved in the late stages of epidermal differentiation, where it deiminates filaggrin and keratin K1, which maintains hydration of the stratum corneum, and hence the cutaneous barrier function. This enzyme may also play a role in hair follicle formation. This gene exists in a cluster with four Other paralogous genes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

PADI1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_013358.3 NP_037490.2 protein-arginine deiminase type-1
基因本体论
  • 分子功能
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables calcium ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27393304 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
28514442 GOA
enables protein-arginine deiminase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27393304 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
12416996 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PADI1 蛋白结构

PAD_N

PAD_N: Protein-arginine deiminase (PAD) N-terminal domain (1 - 113)

PAD_M

PAD_M: Protein-arginine deiminase (PAD) middle domain (115 - 273)

PAD

PAD: Protein-arginine deiminase (PAD) (277 - 663)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 663 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein-arginine deiminase type-1

hPAD-colony 10

PADI1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PADI1 Q9ULC6 STAP2 Homo sapiens Q9UGK3 33961781
种属内
PADI1 Q9ULC6 STAP2 Homo sapiens Q9UGK3 28514442
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta PADI1 VGNC VGNC:106464
Canis familiaris PADI1 VGNC VGNC:44234
Mus musculus PADI1 MGD MGI:1338893
Rattus norvegicus PADI1 RGD RGD:3287
Felis catus PADI1 VGNC VGNC:64021
Bos taurus PADI1 VGNC VGNC:32545