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PODN - podocan Gene

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中文名称：波多坎

种属: Homo sapiens

同用名: PCAN; SLRR5A

基因 ID: 127435 | 基因类型: protein coding

关于 PODN

Cytogenetic location: 1p32.3 Genomic coordinates (GRCh38): 1:53,062,213-53,085,494 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 193 orthologues and 22 paralogues. Broad expression in gall bladder (RPKM 52.1), ovary (RPKM 37.5) and 19 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是富含亮氨酸的小重复蛋白家族的成员，包含一个氨基末端 CX3CXCX7C 富含半胱氨酸簇，后跟一个富含亮氨酸的重复域。研究表明，这种蛋白质可以起到抑制动脉损伤后平滑肌细胞增殖和迁移的作用。[RefSeq 提供，2016 年 7 月]

The protein encoded by this gene is a member of the small leucine-rich repeat protein family and contains an amino terminal CX3CXCX7C cysteine-rich cluster followed by a leucine-rich repeat domain. Studies suggest that this protein could function to inhibit smooth muscle cell proliferation and migration following arterial injury. [provided by RefSeq, Jul 2016]

PODN 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001199080.4 NP_001186009.2 podocan precursor
NM_001199081.3 NP_001186010.2 podocan precursor
NM_153703.5 NP_714914.3 podocan precursor
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables collagen binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15063725 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of cell migration IDA
IDA: 通过直接分析推断
15063725 GOA
involved in negative regulation of cell population proliferation IDA
IDA: 通过直接分析推断
15063725 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
15063725 GOA
located in extracellular space IDA
IDA: 通过直接分析推断
15063725 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

PODN 蛋白结构

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (147 - 206)

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (286 - 348)

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (358 - 419)

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (429 - 490)

LRR_1

LRR_1: Leucine Rich Repeat (550 - 567)

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (571 - 630)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 661 a.a.
蛋白主名 其他名称

podocan

podocan proteoglycan

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纯度 是否罕见病
HY-RS10807 PODN Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-RS19632 Podn Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-RS26127 Podn Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus PODN VGNC VGNC:33101
Felis catus PODN VGNC VGNC:64273
Rattus norvegicus PODN RGD RGD:7545693
Canis familiaris PODN VGNC VGNC:44763
Macaca mulatta PODN VGNC VGNC:76096
Mus musculus PODN MGD MGI:2674939
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