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TRIM47 - tripartite motif containing 47 Gene

中文名称:含三方基序 47

种属: Homo sapiens

同用名: GOA; RNF100

基因 ID: 91107 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM47

Cytogenetic location: 17q25.1 Genomic coordinates (GRCh38): 17:75,874,164-75,878,581 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 166 orthologues and 80 paralogues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 11.4), kidney (RPKM 8.9) and 24 other tissues.

功能概要

启用泛素蛋白转移酶活性。参与蛋白质泛素化。位于胞质溶胶中。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables ubiquitin-protein transferase activity. Involved in protein ubiquitination. Located in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

TRIM47 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_033452.3 NP_258411.2 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM47
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
34110282 GOA
enables ubiquitin-protein transferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
29291351 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in protein ubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
29291351 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TRIM47 蛋白结构

zf-C3HC4_4

zf-C3HC4_4: zinc finger of C3HC4-type, RING (9 - 57)

zf-B_box

zf-B_box: B-box zinc finger (178 - 217)

SPRY

SPRY: SPRY domain (480 - 566)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 600
  • 638 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase TRIM47

RING finger protein 100

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TRIM47 VGNC VGNC:36339
Rattus norvegicus TRIM47 RGD RGD:1597317
Felis catus TRIM47 VGNC VGNC:66543
Macaca mulatta TRIM47 VGNC VGNC:79171
Mus musculus TRIM47 MGD MGI:1917374