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ZNF827 - zinc finger protein 827 Gene

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  • 蛋白
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中文名称：锌指蛋白 827

种属: Homo sapiens

基因 ID: 152485 | 基因类型: protein coding

关于 ZNF827

Cytogenetic location: 4q31.21-q31.22 Genomic coordinates (GRCh38): 4:145,757,627-145,938,823 (from NCBI)

This gene has 22 transcripts (splice variants), 236 orthologues and 36 paralogues. Ubiquitous expression in prostate (RPKM 4.9), thyroid (RPKM 2.3) and 23 other tissues.

功能概要

预测可启用 DNA 结合活性和金属离子结合活性。预测参与 RNA 聚合酶 II 对转录的正调控。预计活跃于核心。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable DNA binding activity and metal ion binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

ZNF827 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001306215.2 NP_001293144.1 zinc finger protein 827 isoform 1
NM_001410850.1 NP_001397779.1 zinc finger protein 827 isoform 3
NM_178835.5 NP_849157.2 zinc finger protein 827 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables NuRD complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
25150861 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25150861 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in chromatin remodeling IMP
IMP: 通过突变表型推断
25150861 GOA
involved in establishment of protein localization to telomere IMP
IMP: 通过突变表型推断
25150861 GOA
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IMP
IMP: 通过突变表型推断
33174841 GOA
involved in negative regulation of shelterin complex assembly IMP
IMP: 通过突变表型推断
25150861 GOA
involved in telomere maintenance IMP
IMP: 通过突变表型推断
25150861 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in chromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
33174841 GOA
located in chromosome, telomeric region IDA
IDA: 通过直接分析推断
25150861 GOA
part of ribonucleoprotein complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
33174841 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

ZNF827 蛋白结构

zf-H2C2_2

zf-H2C2_2: Zinc-finger double domain (390 - 412)

zf-C2H2

zf-C2H2: Zinc finger, C2H2 type (817 - 839)

zf-H2C2_5

zf-H2C2_5: C2H2-type zinc-finger domain (845 - 867)

zf-H2C2_5

zf-H2C2_5: C2H2-type zinc-finger domain (930 - 953)

zf-C2H2_4

zf-C2H2_4: C2H2-type zinc finger (1019 - 1041)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1000
  • 1081 a.a.
蛋白主名 其他名称

zinc finger protein 827

ZNF827 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
ZNF827 Q17R98 MTA2 Homo sapiens O94776
Anti Bait CoIP
25150861
种属内
ZNF827 Q17R98 HDAC2 Homo sapiens Q92769
Anti Bait CoIP
25150861
种属内
ZNF827 Q17R98 RBBP7 Homo sapiens Q16576
Anti Bait CoIP
25150861
种属内
ZNF827 Q17R98 CHD4 Homo sapiens Q14839
Anti Bait CoIP
25150861
种属内
ZNF827 Q17R98 MESD Homo sapiens Q14696
Y2H Array
32296183
种属内
ZNF827 Q17R98 MESD Homo sapiens Q14696
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
ZNF827 Q17R98 GATAD2B Homo sapiens Q8WXI9
Anti Bait CoIP
25150861
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS16177 ZNF827 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus ZNF827 MGD MGI:2444807
Bos taurus ZNF827 VGNC VGNC:55765
Macaca mulatta ZNF827 VGNC VGNC:100288
Rattus norvegicus ZNF827 RGD RGD:1560620
Felis catus ZNF827 VGNC VGNC:80125
Canis familiaris ZNF827 VGNC VGNC:106620
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