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PHF2 - PHD finger protein 2 Gene

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中文名称：PHD 指蛋白 2

种属: Homo sapiens

同用名: GRC5; KDM7C; JHDM1E; CENP-35

基因 ID: 5253 | 基因类型: protein coding

关于 PHF2

Cytogenetic location: 9q22.31 Genomic coordinates (GRCh38): 9:93,576,584-93,679,587 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants), 214 orthologues and 4 paralogues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 14.2), endometrium (RPKM 13.4) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质包含锌指样 PHD (植物同源结构域) 指，不同于其他类别的锌指基序，以及疏水且高度保守的结构域。 PHD 手指显示典型的 Cys4-His-Cys3 排列。 PHD 手指基因被认为属于一组不同的转录调节因子，可能通过影响染色质结构来影响真核基因表达。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a protein which contains a zinc finger-like PHD (plant homeodomain) finger, distinct from Other classes of zinc finger motifs, and a hydrophobic and highly conserved domain. The PHD finger shows the typical Cys4-His-Cys3 arrangement. PHD finger genes are thought to belong to a diverse group of transcriptional regulators possibly affecting eukaryotic gene expression by influencing chromatin structure. [provided by RefSeq, Jul 2008]

PHF2 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005392.4 NP_005383.3 lysine-specific demethylase PHF2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables histone H3K9 demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21532585 GOA
NOT enables histone demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21167174 GOA
enables iron ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21167174 GOA
enables methylated histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20129925 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21532585 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21532585 GOA
enables zinc ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20129925 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of rDNA heterochromatin formation IMP
IMP: 通过突变表型推断
20129925 GOA
involved in protein demethylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
21532585 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in kinetochore IDA
IDA: 通过直接分析推断
20813266 GOA
located in nucleolus IDA
IDA: 通过直接分析推断
20129925 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

PHF2 蛋白结构

PHD

PHD: PHD-finger (7 - 55)

JmjC

JmjC: JmjC domain, hydroxylase (236 - 336)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1000
  • 1096 a.a.
蛋白主名 其他名称

lysine-specific demethylase PHF2

centromere protein 35

PHF2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PHF2 O75151 H2BC21 Homo sapiens Q16778
Crosslink
30021884
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Autism Spectrum Disorder

Asd

Autism Spectrum Disorders

Autistic Continuum

Pervasive Developmental Disorder

Pervasive Development Disorder

Autistic Behavior

Autistic Disorder

Autistic

Autistic Disorder Of Childhood Onset

Infantile Autism

Childhood Autism

Kanner Syndrome

Pervasive Developmental Delay Nos

Pervasive Developmental Disorder, Not Otherwise Specified
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

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直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
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Macaca mulatta PHF2 VGNC VGNC:75974
Bos taurus PHF2 VGNC VGNC:32818
Canis familiaris PHF2 VGNC VGNC:44484
Mus musculus PHF2 MGD MGI:1338034
Rattus norvegicus PHF2 RGD RGD:1305228
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