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HPF1 - histone PARylation factor 1 Gene

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中文名称：组蛋白 PARylation 因子 1

种属: Homo sapiens

同用名: C4orf27

基因 ID: 54969 | 基因类型: protein coding

关于 HPF1

Cytogenetic location: 4q33 Genomic coordinates (GRCh38): 4:169,729,470-169,757,944 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants) and 209 orthologues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 6.3), endometrium (RPKM 6.0) and 25 other tissues.

功能概要

启用染色质结合活性和组蛋白结合活性。参与双链断裂修复；肽基-丝氨酸 ADP-核糖基化；蛋白质修饰过程的调控。位于染色质；核;和 DNA 损伤部位。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables chromatin binding activity and histone binding activity. Involved in double-strand break repair; peptidyl-serine ADP-ribosylation; and regulation of protein modification process. Located in chromatin; nucleus; and site of DNA damage. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

HPF1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017867.3 NP_060337.2 histone PARylation factor 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables chromatin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
32939087 GOA
enables histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27067600 GOA
enables protein ADP-ribosyltransferase-substrate adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
28190768 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
27067600 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA damage response IMP
IMP: 通过突变表型推断
27067600 GOA
involved in DNA repair IDA
IDA: 通过直接分析推断
32028527 GOA
involved in DNA repair-dependent chromatin remodeling IDA
IDA: 通过直接分析推断
32939087 GOA
involved in double-strand break repair IDA
IDA: 通过直接分析推断
32028527 GOA
involved in regulation of protein ADP-ribosylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
33186521 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in chromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
27067600 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
27067600 GOA
is active in site of DNA damage IDA
IDA: 通过直接分析推断
32028527 GOA
located in site of DNA damage IDA
IDA: 通过直接分析推断
32939087 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

HPF1 蛋白结构

DUF2228

DUF2228: Uncharacterised conserved protein (DUF2228) (77 - 328)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 346 a.a.
蛋白主名 其他名称

histone PARylation factor 1

UPF0609 protein C4orf27

HPF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
HPF1 Q9NWY4 MKLN1 Homo sapiens Q9UL63
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
HPF1 Q9NWY4 MKLN1 Homo sapiens Q9UL63
Anti Tag CoIP
28514442
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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疾病名称 别名
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直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus HPF1 MGD MGI:1919862
Bos taurus HPF1 VGNC VGNC:56972
Macaca mulatta HPF1 VGNC VGNC:100235
Rattus norvegicus HPF1 RGD RGD:1311747
Canis familiaris HPF1 VGNC VGNC:50635
Felis catus HPF1 VGNC VGNC:78510
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