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RAP1GDS1 - Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 Gene

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  • 蛋白
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中文名称：Rap1 GTPase-GDP 解离刺激物 1

种属: Homo sapiens

同用名: GDS1; SmgGDS

基因 ID: 5910 | 基因类型: protein coding

关于 RAP1GDS1

Cytogenetic location: 4q23 Genomic coordinates (GRCh38): 4:98,261,384-98,443,858 (from NCBI)

This gene has 21 transcripts (splice variants), 207 orthologues and is associated with 64 phenotypes. Ubiquitous expression in brain (RPKM 27.0), testis (RPKM 10.3) and 25 other tissues.

功能概要

smg GDP 解离刺激物 (smgGDS) 蛋白是一种具有 GTP 酶活性的刺激性 GDP/GTP 交换蛋白 (Riess 等人，1993 [PubMed 8262526]) 。[OMIM 提供，2010 年 2 月]

The smg GDP dissociation stimulator (smgGDS) protein is a stimulatory GDP/GTP exchange protein with GTPase activity (Riess et al., 1993 [PubMed 8262526]).[supplied by OMIM, Feb 2010]

RAP1GDS1 基因产物(6)

mRNA Protein Name
NM_001100426.2 NP_001093896.1 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 1
NM_001100427.2 NP_001093897.1 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 3
NM_001100428.2 NP_001093898.1 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 4
NM_001100429.2 NP_001093899.1 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 5
NM_001100430.2 NP_001093900.1 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 6
NM_021159.5 NP_066982.3 rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables guanyl-nucleotide exchange factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21242305 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20936779 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in CAAX-box protein maturation IMP
IMP: 通过突变表型推断
20709748 GOA
involved in negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration IMP
IMP: 通过突变表型推断
24349085 GOA
involved in positive regulation of mitochondrial calcium ion concentration IMP
IMP: 通过突变表型推断
24349085 GOA
involved in protein localization to nucleus IMP
IMP: 通过突变表型推断
12551911 GOA
involved in regulation of mitochondrion organization IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716788 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
24349085 GOA
located in endoplasmic reticulum IDA
IDA: 通过直接分析推断
24349085 GOA
located in mitochondrion IDA
IDA: 通过直接分析推断
24349085 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
12551911 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RAP1GDS1 蛋白结构

Arm

Arm: Armadillo/beta-catenin-like repeat (83 - 117)

Arm

Arm: Armadillo/beta-catenin-like repeat (169 - 210)

Arm

Arm: Armadillo/beta-catenin-like repeat (346 - 389)

Arm

Arm: Armadillo/beta-catenin-like repeat (481 - 518)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 607 a.a.
蛋白主名 其他名称

rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1

RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1

RAP1GDS1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
RAP1GDS1 P52306 P0DTD1-PRO_0000449620 SARS-CoV-2 P0DTD1-PRO_0000449620
BLI
34159380
种属间
RAP1GDS1 P52306 P0DTD1-PRO_0000449620 SARS-CoV-2 P0DTD1-PRO_0000449620
Y2H Array
36217030
种属内
RAP1GDS1 P52306 RAC1 Homo sapiens P63000
Y2H Pooling
20936779
种属内
RAP1GDS1 P52306 PLEKHB1 Homo sapiens Q9UF11
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
RAP1GDS1 P52306 PLEKHB1 Homo sapiens Q9UF11
Validated Y2H
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS11656 RAP1GDS1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta RAP1GDS1 VGNC VGNC:76659
Bos taurus RAP1GDS1 VGNC VGNC:33718
Mus musculus RAP1GDS1 MGD MGI:2385189
Rattus norvegicus RAP1GDS1 RGD RGD:1308558
Canis familiaris RAP1GDS1 VGNC VGNC:45343
Felis catus RAP1GDS1 VGNC VGNC:69237
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