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SUPT6H - SPT6 homolog, histone chaperone and transcription elongation factor Gene

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中文名称：SPT6 同系物、组蛋白伴侣和转录延伸因子

种属: Homo sapiens

同用名: SPT6; SPT6H; emb-5

基因 ID: 6830 | 基因类型: protein coding

关于 SUPT6H

Cytogenetic location: 17q11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 17:28,662,205-28,702,679 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants) and 221 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 15.3), ovary (RPKM 14.3) and 25 other tissues.

功能概要

启用组蛋白结合活动。参与组蛋白 H3-K27 甲基化的负调控和 RNA 聚合酶 II 启动子转录延伸的正调控。预测位于核质中。预计是转录延伸因子复合体的一部分。预计在转录活性染色质中具有活性。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables histone binding activity. Involved in negative regulation of histone H3-K27 methylation and positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter. Predicted to be located in nucleoplasm. Predicted to be part of transcription elongation factor complex. Predicted to be active in transcriptionally active chromatin. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SUPT6H 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001320755.2 NP_001307684.1 transcription elongation factor SPT6
NM_003170.5 NP_003161.2 transcription elongation factor SPT6
NM_001320755.2 NP_001307684.1 transcription elongation factor SPT6
NM_003170.5 NP_003161.2 transcription elongation factor SPT6
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10933715 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10933715 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II IMP
IMP: 通过突变表型推断
17234882 GOA
involved in transcription elongation-coupled chromatin remodeling IMP
IMP: 通过突变表型推断
23503590 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SUPT6H 蛋白结构

SPT6_acidic

SPT6_acidic: Acidic N-terminal SPT6 (36 - 128)

HTH_44

HTH_44: Helix-turn-helix DNA-binding domain of SPT6 (300 - 436)

YqgF

YqgF: Holliday-junction resolvase-like of SPT6 (775 - 931)

HHH_7

HHH_7: Helix-hairpin-helix motif (935 - 1038)

DLD

DLD: Death-like domain of SPT6 (1050 - 1160)

S1

S1: S1 RNA binding domain (1229 - 1282)

SH2_2

SH2_2: SH2 domain (1296 - 1515)

  • 0
  • 300
  • 600
  • 900
  • 1200
  • 1500
  • 1726 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription elongation factor SPT6

histone chaperone suppressor of Ty6

SUPT6H 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SUPT6H Q7KZ85 ERBB2 Homo sapiens P04626
Protein Array
16273093
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Ichthyosis, Congenital, Autosomal Recessive 11

Autosomal Recessive Congenital Ichthyosis 11

Ichthyosis With Hypotrichosis, Autosomal Recessive

Arih

Ichthyosis And Follicular Atrophoderma With Hypotrichosis And Hypohidrosis

Autosomal Recessive Ichthyosis With Hypotrichosis

ARCI11

Ifah

Hypotrichosis-Congenital Ichthyosis Syndrome

Ichthyosis-Follicular Atrophoderma-Hypotrichosis Syndrome

Ichthyosis-Follicular Atrophoderma-Hypotrichosis-Hypohidrosis Syndrome

Ichthyosis-Hypotrichosis Syndrome

Ifah Syndrome

Ihs
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS14039 SUPT6H Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SUPT6H RGD RGD:1309290
Mus musculus SUPT6H MGD MGI:107726
Macaca mulatta SUPT6H VGNC VGNC:78057
Canis familiaris SUPT6H VGNC VGNC:49096
Bos taurus SUPT6H VGNC VGNC:50619
Felis catus SUPT6H VGNC VGNC:65850
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