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TAF7 - TATA-box binding protein associated factor 7 Gene

中文名称:TATA-box 结合蛋白相关因子 7

种属: Homo sapiens

同用名: TAF2F; TAFII55

基因 ID: 6879 | 基因类型: protein coding

关于 TAF7

Cytogenetic location: 5q31.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:141,318,490-141,320,784 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 185 orthologues and 1 paralogue.

功能概要

该转录共激活因子的无内含子基因位于 5 号染色体上的原钙粘蛋白 β 和 γ 基因簇之间。该基因编码的蛋白质是 TFIID 蛋白复合物的一个组成部分,该复合物与 II 类启动子中的 TATA 盒结合并招募 RNA 聚合酶 II 等因素。这个特殊的亚基与最大的 TFIID 亚基以及多个转录激活因子相互作用。该蛋白质是 RNA 聚合酶 II 靶向的启动子转录所必需的。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

The intronless gene for this transcription coactivator is located between the protocadherin beta and gamma gene clusters on chromosome 5. The protein encoded by this gene is a component of the TFIID protein complex, a complex which binds to the TATA box in class II promoters and recruits RNA polymerase II and Other factors. This particular subunit interacts with the largest TFIID subunit, as well as multiple transcription activators. The protein is required for transcription by promoters targeted by RNA polymerase II. [provided by RefSeq, Jul 2008]

TAF7 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005642.3 NP_005633.2 transcription initiation factor TFIID subunit 7
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA-binding transcription factor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7824954 GOA
contributes to H3K27me3 modified histone binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24927529 GOA
enables P-TEFb complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18391197 GOA
contributes to RNA polymerase II general transcription initiation factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
9603525 GOA
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
7824954 GOA
enables TFIIH-class transcription factor complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18391197 GOA
enables histone acetyltransferase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11592977 GOA
enables nuclear thyroid hormone receptor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10409738 GOA
enables nuclear vitamin D receptor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10409738 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7824954 GOA
enables protein heterodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25412659 GOA
enables transcription cis-regulatory region binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18391197 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of MLL1 complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15960975 GOA
located in nucleus EXP
EXP: 通过实验结果推断
23332750 GOA
is active in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
29203640 GOA
part of transcription factor TFIID complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
7824954 GOA
part of transcription factor TFIID complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
23332750 GOA
part of transcription factor TFTC complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9603525 GOA
part of transcription regulator complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25412659 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TAF7 蛋白结构

TAFII55_N

TAFII55_N: TAFII55 protein conserved region (12 - 177)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 349 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription initiation factor TFIID subunit 7

RNA polymerase II TBP-associated factor subunit F

TAF7 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TAF7 Q15545 UNG Homo sapiens P13051-2 32814053
种属内
TAF7 Q15545 UNG Homo sapiens P13051-2 32814053
种属内
TAF7 Q15545 UNG Homo sapiens P13051-2 32814053
种属内
TAF7 Q15545 TFF2 Homo sapiens Q03403 32814053
种属内
TAF7 Q15545 TFF2 Homo sapiens Q03403 32814053
种属内
TAF7 Q15545 TFF2 Homo sapiens Q03403 32814053
种属内
TAF7 Q15545 PABIR3 Homo sapiens Q6P4D5-2 32814053
种属内
TAF7 Q15545 PABIR3 Homo sapiens Q6P4D5-2 32814053
种属内
TAF7 Q15545 PABIR3 Homo sapiens Q6P4D5-2 32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta TAF7 VGNC VGNC:110430
Canis familiaris TAF7 VGNC VGNC:47087
Felis catus TAF7 VGNC VGNC:97652
Mus musculus TAF7 MGD MGI:1346348
Rattus norvegicus TAF7 RGD RGD:1309935
Bos taurus TAF7 VGNC VGNC:35579