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USP38 - ubiquitin specific peptidase 38 Gene

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中文名称：泛素特异性肽酶 38

种属: Homo sapiens

同用名: HP43.8KD

基因 ID: 84640 | 基因类型: protein coding

关于 USP38

Cytogenetic location: 4q31.21 Genomic coordinates (GRCh38): 4:143,184,917-143,223,874 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 205 orthologues and 71 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 7.3), colon (RPKM 5.9) and 25 other tissues.

功能概要

启用硫醇依赖性去泛素化酶。参与蛋白质去泛素化。预计在胞质溶胶和细胞核中有活性。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables thiol-dependent Deubiquitinase. Involved in protein deubiquitination. Predicted to be active in cytosol and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

USP38 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001290325.1 NP_001277254.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 2
NM_001290326.1 NP_001277255.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 3
NM_001410848.1 NP_001397777.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 4
NM_032557.6 NP_115946.2 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables cysteine-type deubiquitinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
14715245 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32814053 GOA
enables protein sequestering activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
34102342 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of innate immune response IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
involved in negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
34102342 GOA
involved in protein K33-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
27692986 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

USP38 蛋白结构

UCH

UCH: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (445 - 946)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1042 a.a.
蛋白主名 其他名称

ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38

deubiquitinating enzyme 38

USP38 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
USP38 Q8NB14 PRKCA Homo sapiens P17252
Y2H Pooling
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 PRKCA Homo sapiens P17252
Validated Y2H
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 PRKCA Homo sapiens P17252
Y2H Array
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 YWHAG Homo sapiens P61981
Y2H Pooling
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 YWHAG Homo sapiens P61981
Validated Y2H
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 YWHAG Homo sapiens P61981
Y2H Array
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 KAT5 Homo sapiens Q92993
Y2H Pooling
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 KAT5 Homo sapiens Q92993
Validated Y2H
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 KAT5 Homo sapiens Q92993
Y2H Array
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Validated Y2H
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Y2H Array
32814053
种属内
USP38 Q8NB14 SETDB1 Homo sapiens Q15047-2
Y2H Pooling
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (3)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
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HY-RS19493 Usp38 Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-RS25987 Usp38 Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris USP38 VGNC VGNC:48193
Macaca mulatta USP38 VGNC VGNC:79224
Felis catus USP38 VGNC VGNC:66884
Bos taurus USP38 VGNC VGNC:36727
Mus musculus USP38 MGD MGI:1922091
Rattus norvegicus USP38 RGD RGD:1311974
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