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RRP9 - ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein Gene

中文名称:核糖体 RNA 加工 9,U3 小核仁 RNA 结合蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: U3-55K; RNU3IP2

基因 ID: 9136 | 基因类型: protein coding

关于 RRP9

Cytogenetic location: 3p21.2 Genomic coordinates (GRCh38): 3:51,933,429-51,941,904 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant) and 205 orthologues. Ubiquitous expression in appendix (RPKM 6.7), adrenal (RPKM 6.6) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 WD 重复蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质是核仁小核核糖核蛋白颗粒 (snoRNP) 的组成部分,对于核糖体合成过程中的 18s rRNA 加工至关重要。它包含核仁定位和与 U3 小核仁 RNA (U3 snoRNA) 特异性相互作用所需的七个 WD 结构域。[RefSeq 提供,2012 年 10 月]

This gene encodes a member of the WD-repeat protein family. The encoded protein is a component of the nucleolar small nuclear ribonucleoprotein particle (snoRNP) and is essential for 18s rRNA processing during ribosome synthesis. It contains seven WD domains required for nucleolar localization and specific interaction with the U3 small nucleolar RNA (U3 snoRNA). [provided by RefSeq, Oct 2012]

RRP9 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_004704.5 NP_004695.1 U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
contributes to U3 snoRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9418896 GOA
enables U3 snoRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
26867678 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
26867678 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in rRNA processing IDA
IDA: 通过直接分析推断
26867678 GOA
involved in ribosomal small subunit biogenesis IDA
IDA: 通过直接分析推断
34516797 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of box C/D methylation guide snoRNP complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9418896 GOA
located in nucleolus IDA
IDA: 通过直接分析推断
9418896 GOA
part of small-subunit processome IDA
IDA: 通过直接分析推断
34516797 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RRP9 蛋白结构

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (139 - 174)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (196 - 227)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (232 - 269)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (276 - 311)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (317 - 350)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 475 a.a.
蛋白主名 其他名称

U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2

RNA, U3 small nucleolar interacting protein 2

RRP9 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
RRP9 O43818 NOP56 Homo sapiens O00567 33961781
种属内
RRP9 O43818 NOP56 Homo sapiens O00567 30021884
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta RRP9 VGNC VGNC:77028
Felis catus RRP9 VGNC VGNC:64783
Bos taurus RRP9 VGNC VGNC:34172
Canis familiaris RRP9 VGNC VGNC:45767
Mus musculus RRP9 MGD MGI:2384313
Rattus norvegicus RRP9 RGD RGD:1307881