1. Gene
  2. STRN3 - striatin 3 Gene

STRN3 - striatin 3 Gene

中文名称:纹状蛋白 3

种属: Homo sapiens

同用名: SG2NA; S/G2NA; PPP2R6B

基因 ID: 29966 | 基因类型: protein coding

关于 STRN3

Cytogenetic location: 14q12 Genomic coordinates (GRCh38): 14:30,893,804-31,026,379 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 212 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 11.4), fat (RPKM 8.6) and 25 other tissues.

功能概要

启用犰狳重复域绑定活动;蛋白磷酸酶 2A 结合活性;和小的 GTPase 结合活性。参与 RNA 聚合酶 II 转录的负调节和 RNA 聚合酶 II 转录的正调节。位于高尔基体;核质;和质膜。 FAR/SIN/STRIPAK 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables armadillo repeat domain binding activity; protein Phosphatase 2A binding activity; and small GTPase binding activity. Involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in Golgi apparatus; nucleoplasm; and plasma membrane. Part of FAR/SIN/STRIPAK complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

STRN3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001083893.2 NP_001077362.1 striatin-3 isoform 1
NM_014574.4 NP_055389.3 striatin-3 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables armadillo repeat domain binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18502210 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
18782753 GOA
enables protein phosphatase 2A binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18782753 GOA
enables protein-containing complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18782753 GOA
enables protein-macromolecule adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
30622739 GOA
enables small GTPase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25743393 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
11570823 GOA
involved in negative regulation of hippo signaling IDA
IDA: 通过直接分析推断
30622739 GOA
involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
11570823 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
11570823 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of FAR/SIN/STRIPAK complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
18782753 GOA
located in Golgi apparatus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11251078 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
18434427 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
11570823 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
18434427 GOA
located in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
11251078 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

STRN3 蛋白结构

Striatin

Striatin: Striatin family (64 - 197)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (470 - 508)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (524 - 561)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (580 - 614)

WD40

WD40: WD domain, G-beta repeat (714 - 751)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 797 a.a.
蛋白主名 其他名称

striatin-3

cell cycle S/G2 nuclear autoantigen

STRN3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 18782753
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 35271311
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 24366813
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 18782753
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 26496610
种属内
STRN3 Q13033 STRN Homo sapiens O43815 24255178
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 18782753
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 33961781
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 24255178
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 18782753
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 24366813
种属内
STRN3 Q13033 CTTNBP2NL Homo sapiens Q9P2B4 26496610
种属内
STRN3 Q13033 MOB4 Homo sapiens Q9Y3A3-1 33633399
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus STRN3 RGD RGD:621827
Canis familiaris STRN3 VGNC VGNC:46946
Felis catus STRN3 VGNC VGNC:80830
Mus musculus STRN3 MGD MGI:2151064
Bos taurus STRN3 VGNC VGNC:35425
Macaca mulatta STRN3 VGNC VGNC:78127