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Fasn - fatty acid synthase Gene

中文名称:脂肪酸合酶

种属: Rattus norvegicus

基因 ID: 50671 | 基因类型: protein coding

关于 Fasn

Primary_assembly 10: 106,072,091-106,090,261 reverse strand.mRatBN7.2:CM026983.1

This gene has 2 transcripts (splice variants), 195 orthologues, 1 paralogue and is associated with 20 phenotypes. Biased expression in Adrenal (RPKM 37.2), Thymus (RPKM 361.4) and 5 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动 [acyl-carrier-protein] S-丙二酰基转移酶活性和相同的蛋白质结合活性。参与乙酰辅酶A代谢过程和脂肪酸生物合成过程。位于细胞质中。与人类 FASN(脂肪酸合成酶)同源。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables [acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase activity and identical protein binding activity. Involved in acetyl-CoA metabolic process and fatty acid biosynthetic process. Located in cytoplasm. Orthologous to human FASN (fatty acid synthase). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Fasn 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_017332.2 NP_059028.2 fatty acid synthase
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables [acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
8940200 RGD
enables fatty acid synthase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15715522 RGD
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9047334 RGD
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16054098 RGD
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in acetyl-CoA metabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
18062843 RGD
involved in fatty acid biosynthetic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
15715522 RGD
involved in response to nutrient IEP
IEP: 通过表达模式推断
26394137 RGD
involved in response to nutrient levels IEP
IEP: 通过表达模式推断
25943649 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
16054098 RGD
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

Fasn 蛋白结构

PksD

PksD: COG3321 (0 - 1014)

PKS

PKS: cd00833 (1 - 403)

Methyltransf_12

Methyltransf_12: pfam08242 (1237 - 1336)

KR_1_FAS_SDR_x

KR_1_FAS_SDR_x: cd08954 (1310 - 1514)

PKS_ER

PKS_ER: smart00829 (1557 - 1847)

KR_1_FAS_SDR_x

KR_1_FAS_SDR_x: cd08954 (1869 - 2105)

entF

entF: cl35902 (2120 - 2317)

Thioesterase

Thioesterase: pfam00975 (2235 - 2494)

  • 0
  • 400
  • 800
  • 1200
  • 1600
  • 2000
  • 2505 a.a.
蛋白主名 其他名称

fatty acid synthase

type I FAS

Fasn 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785
EM
15711565
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785 10206962
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785
Y2H
11248039
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785 11248039
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785
GMS
9047334
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785 19151726
种属内
Fasn P12785 Fasn Rattus norvegicus P12785 9047334
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Fasn NCBI NCBI:2194