Cy3 NHS ester  (Synonyms: Cyanine3 NHS ester)

Cy3 NHS ester is a CY dye. CY, short for Cyanine, is a compound consisting of two nitrogen atoms connected by an odd number of methyl units. Cyanine compounds have the characteristics of long wavelength, adjustable absorption and emission, high extinction coefficient, good water solubility and relatively simple synthesis^[1]. CY dyes are of en used for the labeling of proteins, antibodies and small molecular compounds. For the labeling of protein antibodies, the combination can be completed through a simple mixing reaction. Below, we introduce the labeling method of protein antibody labeling, which has certain reference significance^[2].

Protocol
一、蛋白制备
1) 为获得最佳标记效果，请制备蛋白 (抗体) 浓度为 2 mg/mL。
2) 蛋白溶液的 PH 值为 8.5±0.5。如果 pH 值低于 8.0，应使用 1 M 碳酸氢钠进行调节。
3) 如果蛋白浓度低于 2 mg/mL，标记效率会大大降低。为获得最佳标记效率，建议终蛋白浓度范围为 2-10 mg/mL。
4) 蛋白必须在不含伯胺 (如 Tris 或甘氨酸) 的缓冲液中，并且铵离子，否则会影响标记效率。
2.染料制备 (以 CY3-NHS 酯为例)
将无水 DMSO 加入 CY3 NHS ester 小瓶中，制成 10 mM 储备液。通过移液器或涡旋混合均匀。
3.染料用量的计算
反应所需的 CY3 NHS ester 的量取决于待标记蛋白的量，CY 染料与蛋白的最佳摩尔比为 10 左右。
Example：假设所需的 marker protein 为 500 μL 2 mg/mL IgG (MW=150，000)，用 100 μL DMSO 溶解 1 mg CY3-NHS ester，得到所需的 CY3-NHS ester 体积为 3.95 μL，详细计算过程如下：
1) mmol (IgG) =mg/mL (IgG) ×mL (IgG)/MW (IgG) =2 mg/mL × 0.5 mL/150，000 mg/mmol= 6.7×10^-6 mmol
2) mmol (CY3 NHS ester) =mmol (IgG) × 10=6.7×10^-6 mmol×10=6.7 × 10^-5 mmol
3) μL (CY3 NHS ester) = mmol (CY3 NHS ester) ×MW (CY3 NHS ester)/mg/μL (CY3 NHS ester) =6.7 ×10^-5 mmol ×590.15 mg/mmol/0.01 mg/μL=3.95 μL (CY3 NHS ester)
4.运行偶联反应
1) 将适量新鲜制备的 10 mg/mL CY3 NHS ester 缓慢加入到 0.5 mL 蛋白质样品中
在溶液中，轻轻摇动混匀，然后短暂离心，将样品收集在反应管底部。请勿混匀，以免蛋白样品变性失活。
2) 将反应管置于避光处，在室温下间隔轻轻孵育 60 分钟。10-15 分钟，轻轻逆转反应
5.纯化偶联物
以下方案是使用 SepHadex G-25 柱纯化染料-蛋白偶联物的示例。
1) 根据制造说明准备 SepHadex G-25 柱。
2) 将反应混合物加载到 SepHadex G-25 柱的顶部。
3) 一旦样品在顶部树脂表面下方运行，立即添加 PBS (pH 7.2-7.4)。
4) 向所需样品添加更多 PBS (pH 7.2-7.4) 以完成柱纯化。合并含有所需染料-蛋白质偶联物的级分。

MCE has not independently confirmed the accuracy of these methods. They are for reference only.

590.15

C₃₄H₄₀ClN₃O₄

1393363-07-9

固体

Brown to breen

570

550

Room temperature in continental US; may vary elsewhere.

-20°C, protect from light, stored under nitrogen

*In solvent : -80°C, 6 months; -20°C, 1 month (protect from light, stored under nitrogen)

* 请根据产品在不同溶剂中的溶解度选择合适的溶剂配制储备液；一旦配成溶液，请分装保存，避免反复冻融造成的产品失效。
储备液的保存方式和期限：-80°C, 6 months; -20°C, 1 month (protect from light, stored under nitrogen)。-80°C储存时，请在6个月内使用，-20°C储存时，请在1个月内使用。

• [1]. Ptaszek M. Rational design of fluorophores for in vivo applications. Prog Mol Biol Transl Sci. 2013;113:59-108.  [Content Brief]

  [2]. Shindy, H. A. (2017). Fundamentals in the chemistry of cyanine dyes: A review. Dyes and Pigments, 145, 505–513. doi:10.1016/j.dyepig.2017.06.029