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SMYD5 - SMYD family member 5 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：SMYD 家族成员 5

种属: Homo sapiens

同用名: RRG1; RAI15; NN8-4AG; ZMYND23

基因 ID: 10322 | 基因类型: protein coding

关于 SMYD5

Cytogenetic location: 2p13.2 Genomic coordinates (GRCh38): 2:73,214,245-73,227,221 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 202 orthologues and 5 paralogues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 8.4), testis (RPKM 6.1) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用组蛋白甲基转移酶活性 (H4-K20 特异性) 。参与转座的负调控和干细胞分化的调控。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable Histone Methyltransferase activity (H4-K20 specific). Involved in negative regulation of transposition and regulation of stem cell differentiation. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SMYD5 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_006062.3 NP_006053.2 histone-lysine N-trimethyltransferase SMYD5
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in regulation of stem cell differentiation IMP
IMP: 通过突变表型推断
28951459 GOA
involved in retrotransposon silencing by heterochromatin formation IMP
IMP: 通过突变表型推断
28951459 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SMYD5 蛋白结构

SET

SET: SET domain (33 - 351)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 418 a.a.
蛋白主名 其他名称

histone-lysine N-trimethyltransferase SMYD5

SET and MYND domain-containing protein 5

SMYD5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
SMYD5 Q6GMV2 Ppargc1a Mus musculus O70343
Methyltransferase Ass
35643234
种属间
SMYD5 Q6GMV2 Ppargc1a Mus musculus O70343
Anti Tag CoIP
35643234
种属内
SMYD5 Q6GMV2 ZNF587 Homo sapiens Q96SQ5
Validated Y2H
32296183
种属内
SMYD5 Q6GMV2 ZNF417 Homo sapiens Q8TAU3
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

相关产品

Pre-clinical Phase
生物活性分子 (2)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13469 SMYD5 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-RS21760 Smyd5 Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus SMYD5 MGD MGI:108048
Macaca mulatta SMYD5 VGNC VGNC:77719
Rattus norvegicus SMYD5 RGD RGD:1309153
Canis familiaris SMYD5 VGNC VGNC:46583
Felis catus SMYD5 VGNC VGNC:65513
Bos taurus SMYD5 VGNC VGNC:35046
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