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POLR1E - RNA polymerase I subunit E Gene

中文名称:RNA 聚合酶 I 亚基 E

种属: Homo sapiens

同用名: A49; PAF53; PRAF1; RPA49

基因 ID: 64425 | 基因类型: protein coding

关于 POLR1E

This gene has 3 transcripts (splice variants) and 201 orthologues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 15.6), endometrium (RPKM 8.0) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用 DNA 结合活性; DNA 指导的 5'-3' RNA 聚合酶活性;和 RNA 聚合酶 I 一般转录起始因子结合活性。参与 RNA 聚合酶 I 的核仁大 rRNA 转录。位于纤维中心和核质中。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to enable DNA binding activity; DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; and RNA polymerase I general transcription initiation factor binding activity. Involved in nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I. Located in fibrillar center and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

POLR1E 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001282766.2 NP_001269695.1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 isoform 2
NM_022490.4 NP_071935.1 DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14743216 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I IDA
IDA: 通过直接分析推断
24207024 GOA
involved in transcription initiation at RNA polymerase I promoter IDA
IDA: 通过直接分析推断
16809778 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of RNA polymerase I complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
16809778 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

POLR1E 蛋白结构

RNA_pol_I_A49

RNA_pol_I_A49: A49-like RNA polymerase I associated factor (97 - 475)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 481 a.a.
蛋白主名 其他名称

DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49

DNA-directed RNA polymerase I subunit E

POLR1E 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
POLR1E Q9GZS1 KLK6 Homo sapiens Q92876 32814053
种属内
POLR1E Q9GZS1 KLK6 Homo sapiens Q92876 32814053
种属内
POLR1E Q9GZS1 KLK6 Homo sapiens Q92876 32814053
种属内
POLR1E Q9GZS1 NFKBIB Homo sapiens Q15653
TAP
14743216
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus POLR1E RGD RGD:1565773
Macaca mulatta POLR1E VGNC VGNC:76047
Felis catus POLR1E VGNC VGNC:64288
Mus musculus POLR1E MGD MGI:1929022
Canis familiaris POLR1E VGNC VGNC:44791
Bos taurus POLR1E VGNC VGNC:33134