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KDM4A - lysine demethylase 4A Gene

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中文名称：赖氨酸脱甲基酶 4A

种属: Homo sapiens

同用名: JMJD2; JHDM3A; JMJD2A; TDRD14A

基因 ID: 9682 | 基因类型: protein coding

关于 KDM4A

Cytogenetic location: 1p34.2-p34.1 Genomic coordinates (GRCh38): 1:43,650,149-43,705,518 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 137 orthologues and 10 paralogues. Ubiquitous expression in duodenum (RPKM 11.5), thyroid (RPKM 10.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因是 Jumonji 结构域 2 (JMJD2) 家族的成员，编码的蛋白质包含一个 JmjN 结构域、一个 JmjC 结构域、一个 JD2H 结构域、两个 TUDOR 结构域和两个 PHD 型锌指。这种核蛋白作为三甲基化特异性去甲基化酶发挥作用，将特定的三甲基化组蛋白残基转化为二甲基化形式，并作为转录抑制因子发挥作用。[RefSeq 提供，2009 年 4 月]

This gene is a member of the Jumonji domain 2 (JMJD2) family and encodes a protein containing a JmjN domain, a JmjC domain, a JD2H domain, two TUDOR domains, and two PHD-type zinc fingers. This nuclear protein functions as a trimethylation-specific demethylase, converting specific trimethylated histone residues to the dimethylated form, and as a transcriptional repressor. [provided by RefSeq, Apr 2009]

KDM4A 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_014663.3 NP_055478.2 lysine-specific demethylase 4A
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables histone H3K36 demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
16024779 GOA
enables histone H3K9me2/H3K9me3 demethylase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
21914792 GOA
enables methylated histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22373579 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16415788 GOA
enables ubiquitin protein ligase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
22373579 GOA
enables zinc ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
27214403 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
16024779 GOA
involved in negative regulation of autophagy IMP
IMP: 通过突变表型推断
25660547 GOA
involved in negative regulation of gene expression IMP
IMP: 通过突变表型推断
25660547 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
16024779 GOA
located in nucleus IMP
IMP: 通过突变表型推断
21914792 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

KDM4A 蛋白结构

JmjN

JmjN: jmjN domain (15 - 49)

JmjC

JmjC: JmjC domain, hydroxylase (175 - 291)

PHD_2

PHD_2: PHD-finger (732 - 766)

zf-HC5HC2H_2

zf-HC5HC2H_2: PHD-zinc-finger like domain (774 - 884)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1000
  • 1064 a.a.
蛋白主名 其他名称

lysine-specific demethylase 4A

[histone H3]-trimethyl-L-lysine(36) demethylase 4A

KDM4A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
KDM4A O75164 H4C16 Homo sapiens P62805
Pull Down
22373579
种属内
KDM4A O75164 H4C16 Homo sapiens P62805
Far-WB
16415788
种属内
KDM4A O75164 H4C16 Homo sapiens P62805
Pull Down
16415788
种属内
KDM4A O75164 H4C16 Homo sapiens P62805
SPR
16415788
种属内
KDM4A O75164 H3-4 Homo sapiens Q16695
SPR
17567753
种属内
KDM4A O75164 H3-4 Homo sapiens Q16695
Demethylase Assay
17567753
种属内
KDM4A O75164 H3-4 Homo sapiens Q16695
X-Ray Diffraction
17567753
种属内
KDM4A O75164 H3C1 Homo sapiens P68431
Far-WB
16415788
种属内
KDM4A O75164 H3C1 Homo sapiens P68431
Pull Down
16415788
种属内
KDM4A O75164 H3C1 Homo sapiens P68431
SPR
16415788
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

KDM4A 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P83586 KDM4A/JHDM3A/JMJD2A Antibody (YA3331) WB, IP Human
HY-P85236 KDM4A/JHDM3A/JMJD2A Antibody (YA4928) WB; IHC-P; IHC-F; IP; IF Human, Mouse, Rat

关联疾病

疾病名称 别名
Primary Hyperoxaluria

Hyperoxaluria

Hyperoxaluria, Primary

Oxalosis

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Glycolic Aciduria

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Oxaluria, Primary

Peroxisomal Alanine:Glyoxylate Aminotransferase Deficiency

Primary Oxaluria

Hyperoxaluria Primary

Primary Hyperoxaluria Type 2

Primary Hyperoxaluria, Type I
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

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HY-110154 NSC636819 98.90% 否
HY-128343 KDM4-IN-2 Inhibitor 98.29% 否
HY-120766 NCDM-32B Inhibitor 97.0% 否
HY-RS07213 KDM4A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-100760S Toxoflavin-13C4 Inhibitor / 否
HY-150619 KDM4-IN-4 Inhibitor / 否
HY-173135 PROTAC KDM4 degrader-1 / 否
HY-RS17467 Kdm4a Mouse Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否
HY-RS23925 Kdm4a Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus KDM4A VGNC VGNC:30527
Rattus norvegicus KDM4A RGD RGD:1306378
Macaca mulatta KDM4A VGNC VGNC:99987
Felis catus KDM4A VGNC VGNC:80248
Mus musculus KDM4A MGD MGI:2446210
Canis familiaris KDM4A VGNC VGNC:42324
Others KDM4A NCBI
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